В конструировании отсутствует нижняя плита перекрытия

Судя по Вашим иллюстрациям, самые основные свойства для неё заданы правильно.
По идее, всё должно было получиться, как на прилагаемой мною картинке.
Проверьте, пожалуйста, может, она сделана у Вас временно невидимой.
Для этого нажмите пиктограмму "Показать все элементы".
Второй вариант: возможно, фундаментную плиту Вы создали уже после того, как сформировали постаналитику (расчётную модель).
В этом случае всенепременно поможет кнопочка "Обновить" на вкладке "Аналитика".
По нажатию этой кнопки заново формируется расчётная модель на основе текущего состояния аналитической. Полностью, или только для выделенных элементов, если таковые присутствуют.
Третий вариант: что-то с настройкой видимости слоёв. Пластина фунд плиты по какой-то случайности отнесена к слою, для которого выключена видимость. Воспользуйтесь древовидным списком в окне "Структура" и удалите (с помощью контекстного меню) объект "Аналитическая модель вариант ...". Потом создайте постаналитику заново на основе имеющейся у Вас физической модели в её аналитическом представлении.
Или, не удаляя всю модель, выделите пластину фунд.плиты через всё тот же список в окне "Структура" и в окне "Свойства" задайте для неё другой слой, видимый в текущем наборе.

Ещё позвольте дать рекомендацию оффтоп не по сути вопроса. Есть более новый релиз (2013р5) некоммерческой версии. В него включены САПФИР-2015 и ЛИРА-САПР-2013, которая умеет читать его файлы.