1. Чего-то мне не понятно. Я использую реальную жёсткость настила именно для сбора нагрузок, а то что он имеет небольшую жёсткость разве это на что-то влияет. С EY или без EY, всё равно нужно задавать пластину и её параметры, так почему бы не задать реальные параметры настила?
2. В выделенном вами месте я специально не соединялся настилом с балкой, так как к ней превариваться не будут. Кстате, а по подкосу с положительным N то что? правильно это или нет?
3. А вот и ещё один досадный момент возник

Посчитав момент 6-ти метровой балки (которая обведена на моём рисунке) вручную, я получил M=1,305 кн*м. Посмотрел момент, который выдала Лира (от временной нагрузки 290 кг/м2, которая передаётся на балки через настил) получил M=1.539кн*м (уменьшение шага треангуляции пластин результата не дало) Почему так???
PS> Вроде бы делаешь всё-так подробно, а результаты оставляют желать лучшего :/