По вопросам применения модулей армирования, почитайте help к ЛИР-АРМ – там можно найти все пояснения. Если вкратце, то выбор стержень, балка, колонна – позволяет учесть конструктивные особенности. При выборе стержня не учитываются конструктивные требования, регламентируемые нормативными документами, при выборе балка или колонна ситуация кардинально противоположная. Что касается, модулей армирования плита, балка-стенка, оболочка, то основным критерием является не местоположение в пространстве, а типы конечных элементов, используемые непосредственно в Лире. Т.е. если, Вы, в Лире используете КЭ оболочки, то и в ЛИР-АРМе будете применять модуль армирования оболочка. Во главе угла стоит характер работы элементов, который Вы сами задаете, тут уж только Вам лучше знать.
Касаемо фундамента под дымовую трубу, что Вы потом будете делать с «пирожком» из плит, каждая из которых будет иметь свое армирование
, да и модель мягко скажем не очень корректна. Я думаю здесь массивную призму все-таки объемниками моделировать необходимо, можно конечно стержнем Тимошенко и введением абсолютно жесткого тела в месте сопряжения с плитной частью. Не берусь давать рекомендации не зная, что вызывает у Вас сложность в расчете и армировании .
А вообще, по-моему, быстрее и надежнее будет ручками посчитать.